Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCS1P62166 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCS1P62166 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCS1P62166 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCS1P62166 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCS1P62166 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms