Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms