Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4A1P60842 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms