Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms