Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms