Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms