Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSCP56915 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSCP56915 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSCP56915 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSCP56915 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSCP56915 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSCP56915 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSCP56915 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSCP56915 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSCP56915 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSCP56915 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSCP56915 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms