Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD4P55036 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms