Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EMP1P54849 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMP1P54849 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMP1P54849 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms