Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRLP54845 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NRLP54845 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NRLP54845 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRLP54845 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRLP54845 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRLP54845 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRLP54845 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRLP54845 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms