Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.86	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.86	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.86	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YEH2	YLR020C	1617 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YOR022C	YOR022C	2148 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YKR015C	YKR015C	1707 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	MIC26	YGR235C	702 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	MRP8	YKL142W	660 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YAL056C-A	YAL056C-A	351 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	POP8	YBL018C	402 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	CCS1	YMR038C	750 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	RRN9	YMR270C	1098 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	DSS4	YPR017C	432 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	LYP1	YNL268W	1836 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YRB30	YGL164C	1323 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	GCN5	YGR252W	1320 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	GLO3	YER122C	1482 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YLR345W	YLR345W	1530 nt		3.85	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	CTR86	YCR054C	1692 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	SIP1	YDR422C	2448 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	PHO87	YCR037C	2772 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	NOP6	YDL213C	678 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	BUD26	YDR241W	288 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	SPT4	YGR063C	309 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	REC104	YHR157W	549 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	ARG3	YJL088W	1017 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	SAW1	YAL027W	786 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YJR071W	YJR071W	369 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YKT6	YKL196C	603 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YLR444C	YLR444C	303 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YNL171C	YNL171C	369 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	RFM1	YOR279C	933 nt		3.84	□□□□□ -1.79
DSL1	P53847	YNR065C	YNR065C	3351 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YCR007C	YCR007C	720 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	API2	YDR525W	330 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YER034W	YER034W	558 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RPB3	YIL021W	957 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RSM25	YIL093C	795 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YLR198C	YLR198C	360 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	ECM15	YBL001C	315 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	NRK1	YNL129W	723 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	UAF30	YOR295W	687 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	FDH2	YPL275W	711 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	DBP5	YOR046C	1449 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	UBP10	YNL186W	2379 nt		3.83	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SER3	YER081W	1410 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	PST1	YDR055W	1335 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YCL075W	YCL075W	441 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	COS8	YHL048W	1146 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	FSH1	YHR049W	732 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RPP0	YLR340W	939 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	GAB1	YLR459W	1185 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	MCM1	YMR043W	861 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	TMC1	YOR052C	453 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YOR342C	YOR342C	960 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	MRP2	YPR166C	348 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.82	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	APE2	YKL157W	2859 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SPS2	YDR522C	1509 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	DIT2	YDR402C	1470 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RXT3	YDL076C	885 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	VFA1	YER128W	612 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SOD1	YJR104C	465 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	ERV41	YML067C	1059 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	IZH4	YOL101C	939 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YOL118C	YOL118C	309 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SPP381	YBR152W	876 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	CSH1	YBR161W	1131 nt		3.81	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SAF1	YBR280C	1914 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RDI1	YDL135C	609 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	TAF10	YDR167W	621 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YDR230W	YDR230W	348 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	TYS1	YGR185C	1185 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	ASC1	YMR116C	960 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	EOS1	YNL080C	1101 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	OPY1	YBR129C	987 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	LDH1	YBR204C	1128 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.8	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	TEC1	YBR083W	1461 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	CIT1	YNR001C	1440 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	ISC10	YER180C	804 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YOR114W	YOR114W	885 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YPL162C	YPL162C	822 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	OXR1	YPL196W	822 nt		3.79	□□□□□ -1.8

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