Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP2S1P53680 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms