Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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