Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV2P52735 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV2P52735 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV2P52735 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV2P52735 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV2P52735 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV2P52735 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV2P52735 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV2P52735 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV2P52735 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV2P52735 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV2P52735 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV2P52735 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV2P52735 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV2P52735 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV2P52735 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV2P52735 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV2P52735 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV2P52735 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV2P52735 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV2P52735 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV2P52735 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV2P52735 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV2P52735 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV2P52735 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAV2P52735 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAV2P52735 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAV2P52735 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAV2P52735 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAV2P52735 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV2P52735 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms