Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNHP51946 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNHP51946 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNHP51946 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNHP51946 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNHP51946 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNHP51946 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNHP51946 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNHP51946 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNHP51946 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNHP51946 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNHP51946 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNHP51946 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNHP51946 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNHP51946 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNHP51946 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNHP51946 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNHP51946 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNHP51946 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNHP51946 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms