Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms