Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCN3P51790 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN3P51790 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms