Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A2P50993 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms