Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRE11P49959 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRE11P49959 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MRE11P49959 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRE11P49959 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRE11P49959 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRE11P49959 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MRE11P49959 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRE11P49959 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms