Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLK1P49759 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLK1P49759 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLK1P49759 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLK1P49759 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLK1P49759 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms