Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 214.53□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 PTOV1-216ENST00000601093 522 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 CCDC136-201ENST00000297788 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 29.1
AARSP49588 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 28.8
AARSP49588 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 28.8
AARSP49588 STX5-207ENST00000491231 1719 ntTSL 522.23■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 28.8
AARSP49588 STX5-208ENST00000492066 1627 ntTSL 521.11■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 28.8
AARSP49588 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 28.8
AARSP49588 ARFGAP2-227ENST00000533243 1558 ntTSL 221.84■■□□□ 1.095e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 514.36□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.07□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 28.4
AARSP49588 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 28.4
AARSP49588 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 528.34■■■□□ 2.138e-7■■■■■ 28.4
AARSP49588 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)22.78■■□□□ 1.248e-7■■■■■ 28.4
AARSP49588 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 28.4
AARSP49588 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 28.4
AARSP49588 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 28.3
AARSP49588 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 28.3
AARSP49588 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.3
AARSP49588 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.873e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 519.02■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 FBXL18-202ENST00000415009 2526 ntTSL 217.2■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -03e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.923e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 56.51□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.843e-9■■■■■ 28.3
AARSP49588 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 27.8
AARSP49588 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 27.8
AARSP49588 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 27.8
AARSP49588 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 27.7
AARSP49588 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 27.6
AARSP49588 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 27.6
AARSP49588 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 27.6
AARSP49588 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 27.6
AARSP49588 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 230.59■■■□□ 2.495e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.425e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)27.07■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 27.5
AARSP49588 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-208ENST00000470335 824 ntTSL 221.89■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.995e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.985e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 219.85■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NSD3-211ENST00000534155 577 ntTSL 419.43■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-203ENST00000431430 572 ntTSL 417.25■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NSD3-210ENST00000529223 1032 ntTSL 517.01■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NFAT5-210ENST00000567990 2855 ntTSL 516.53■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 ANXA11-204ENST00000437799 610 ntTSL 216.41■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-207ENST00000458248 742 ntTSL 316.35■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-205ENST00000444967 1045 ntTSL 316.19■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 BCORL1-204ENST00000488135 857 ntTSL 315.77■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-212ENST00000494929 550 ntTSL 415.76■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-204ENST00000443285 792 ntTSL 415.56■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DIAPH1-210ENST00000494967 629 ntTSL 215.23■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-209ENST00000479601 1389 ntTSL 515.04■□□□□ -05e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-206ENST00000564610 1876 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-214ENST00000567440 2271 ntTSL 514.73□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-216ENST00000567974 1950 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 BCORL1-206ENST00000607874 468 ntTSL 314.49□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-213ENST00000551899 572 ntTSL 414.02□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-207ENST00000565443 2305 ntTSL 213.61□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 KLHL22-206ENST00000451553 724 ntTSL 312.74□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-204ENST00000419739 1718 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 512.71□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DIAPH1-209ENST00000491754 557 ntTSL 412.64□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NSD3-203ENST00000433384 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-203ENST00000413097 2750 ntTSL 211.77□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-207ENST00000549933 536 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-209ENST00000550455 481 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-212ENST00000551620 776 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-210ENST00000550638 683 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 27.5
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 168.7 ms