Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POU3F4P49335 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU3F4P49335 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms