Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC11A1P49279 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms