Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX1P48742 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX1P48742 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX1P48742 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX1P48742 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX1P48742 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms