Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC10P48553 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms