Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCLMP48507 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCLMP48507 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCLMP48507 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLMP48507 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLMP48507 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLMP48507 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms