Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCLCP48506 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCLCP48506 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCLCP48506 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCLCP48506 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLCP48506 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLCP48506 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLCP48506 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLCP48506 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLCP48506 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCLCP48506 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCLCP48506 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCLCP48506 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GCLCP48506 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCLCP48506 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms