Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSN1S1P47710 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSN1S1P47710 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms