Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOP2P46087 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOP2P46087 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOP2P46087 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOP2P46087 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms