Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR1P43307 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR1P43307 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR1P43307 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR1P43307 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR1P43307 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR1P43307 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR1P43307 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR1P43307 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms