Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCAMP43121 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MCAMP43121 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCAMP43121 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCAMP43121 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCAMP43121 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCAMP43121 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCAMP43121 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCAMP43121 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCAMP43121 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCAMP43121 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCAMP43121 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCAMP43121 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCAMP43121 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms