Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTRLP40313 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms