Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 PEX21YGR239C 867 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 TDA3YHR009C 1572 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YKR070WYKR070W 1059 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 VMA6YLR447C 1038 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SUB1YMR039C 879 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 PLP2YOR281C 861 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 DIM1YPL266W 957 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 LOA1YPR139C 903 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ARA1YBR149W 1035 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 REI1YBR267W 1182 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 RAD26YJR035W 3258 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YJR061WYJR061W 2808 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 OPT2YPR194C 2634 nt3.57□□□□□ -1.84
AVT5P38176 MAG2YLR427W 2013 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 GAD1YMR250W 1758 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 NMD3YHR170W 1557 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 UBP8YMR223W 1416 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ESC2YDR363W 1371 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 COM2YER130C 1332 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YDL094CYDL094C 510 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YDR526CYDR526C 471 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YKL123WYKL123W 381 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 NMA1YLR328W 1206 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 HTA2YBL003C 399 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SIW14YNL032W 846 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ATG34YOL083W 1239 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 MCM7YBR202W 2538 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 GIP4YAL031C 2283 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ADP1YCR011C 3150 nt3.56□□□□□ -1.84
AVT5P38176 GAT2YMR136W 1683 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 MLH2YLR035C 2088 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 RSC3YDR303C 2658 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ATP16YDL004W 483 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SPT15YER148W 723 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 JAC1YGL018C 555 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 Q0142Q0142 177 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 TYS1YGR185C 1185 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ECM34YHL043W 513 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YLL037WYLL037W 381 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 USB1YLR132C 873 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SRT1YMR101C 1032 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 NIS1YNL078W 1224 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 snR44snR44 211 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 RIM4YHL024W 2142 nt3.55□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ALR2YFL050C 2577 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YCL075WYCL075W 441 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 COS12YGL263W 1143 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SOL3YHR163W 750 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 PCL7YIL050W 858 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YIL165CYIL165C 360 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 PIR3YKL163W 978 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 NKP2YLR315W 462 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 NBP1YLR457C 960 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YOL106WYOL106W 354 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 PNG1YPL096W 1092 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 MRPS9YBR146W 837 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YMR221CYMR221C 1515 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 XRS2YDR369C 2565 nt3.54□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SWI1YPL016W 3945 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 CTR86YCR054C 1692 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 RDI1YDL135C 609 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YDL162CYDL162C 357 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 NBP2YDR162C 711 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 BET1YIL004C 429 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 ARC15YIL062C 465 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SRP40YKR092C 1221 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YLR339CYLR339C 552 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 RFM1YOR279C 933 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 MSA1YOR066W 1890 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 SPS2YDR522C 1509 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 NAM2YLR382C 2685 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 YER077CYER077C 2067 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 GLO3YER122C 1482 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 PTR3YFR029W 2037 nt3.53□□□□□ -1.84
AVT5P38176 URC2YDR520C 2319 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SRB5YGR104C 924 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RPL24BYGR148C 468 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 COX2Q0250 756 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 OAR1YKL055C 837 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 PNP1YLR209C 936 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 TAP42YMR028W 1101 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 TPT1YOL102C 693 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YOR152CYOR152C 771 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 IDI1YPL117C 867 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YAR1YPL239W 603 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YPR174CYPR174C 666 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YBR116CYBR116C 528 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 ICS2YBR157C 768 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 NOP58YOR310C 1536 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 MET12YPL023C 1974 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 HCA4YJL033W 2313 nt3.52□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YPR003CYPR003C 2265 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 SMP3YOR149C 1551 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 RPP1AYDL081C 321 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 snR83snR83 306 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 YDR220CYDR220C 294 nt3.51□□□□□ -1.85
AVT5P38176 GAT3YLR013W 426 nt3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms