Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP62P37198 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP62P37198 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP62P37198 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP62P37198 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP62P37198 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms