Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF1P36956 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms