Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2IP36954 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms