Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA7P36544 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms