Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5C1P36542 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms