Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK1P35558 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK1P35558 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK1P35558 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCK1P35558 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK1P35558 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCK1P35558 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCK1P35558 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCK1P35558 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCK1P35558 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms