Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA13P31271 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA13P31271 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms