Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms