Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND3P30281 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND3P30281 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND3P30281 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND3P30281 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND3P30281 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND3P30281 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND3P30281 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND3P30281 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND3P30281 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND3P30281 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms