Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND2P30279 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND2P30279 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND2P30279 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND2P30279 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND2P30279 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND2P30279 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND2P30279 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND2P30279 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND2P30279 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND2P30279 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND2P30279 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND2P30279 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND2P30279 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND2P30279 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCND2P30279 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND2P30279 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND2P30279 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND2P30279 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms