Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC27P30260 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC27P30260 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC27P30260 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC27P30260 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC27P30260 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC27P30260 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms