Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5DP30049 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5DP30049 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5DP30049 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP5DP30049 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP5DP30049 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5DP30049 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms