Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH4A1P30038 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALDH4A1P30038 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms