Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms