Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP1P29466 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP1P29466 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP1P29466 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP1P29466 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP1P29466 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP1P29466 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP1P29466 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP1P29466 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP1P29466 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP1P29466 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP1P29466 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP1P29466 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP1P29466 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP1P29466 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP1P29466 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP1P29466 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP1P29466 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms