Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms