Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ABCD3P28288 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms